宁夏医科大学研究生院我校学位和研究生教育始于1978年，首次招收研究生24人。招生专业涉及10个学科。1986年，人体解剖学、生理学、药理学、放射学等四个学科率先获得硕士学位点，成为宁夏第一个获得硕士学位的单位。2000年，他们分别获得了与研究生同等学力的硕士学位申请工作单位和临床医学硕士学位教育试点工作单位。
2008年被授予硕士研究生推荐人选资格和大学教师硕士研究生招生资格。2013年，学校被教育部批准为博士学位授予单位，获得临床医学、基础医学、公共卫生、预防医学三个一级学科博士学位授权。2014年，该校首次招收10名博士生。2017年，学校新增临床博士学位授权点，招收临床博士研究生15名，口腔医学硕士授权主修科目和护理学硕士授权点。
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